O Campeonato Estadual de Futebol Profissional Série A, temporada de 2006, acontece entre os dias 29 de janeiro a 25 de junho. A competição tem fases classificatória e final, principal alteração em relação as duas últimas edições.O campeão e o vice do Estadual representam Mato Grosso do Sul no Campeonato Brasileiro de Futebol da Série C e Copa do Brasil, promovidos e organizados pela Confederação Brasileira de Futebol (CBF) em 2006 e 2007, respectivamente.
Ao final do Estadual 2006, as oito equipes primeiras colocadas, na fase classificatória, garantem automaticamente vaga para o Estadual da Série A em 2007. As duas últimas são rebaixadas para o Campeonato da Série B. Os quatro melhores classificados na segunda divisão em 2006 sobem para a primeira divisão, que vai contar com 12 times em 2007, segundo noticiou ontem o Corumbá On Line.
Participam da Série A em 2006 os seguintes clubes: Centro Esportivo Nova Esperança (Cene); Clube Atlético Mundo Novo; Esporte Clube Águia Negra; Maracajú Atlético Clube; Operário Futebol Clube S/A; Pantanal Futebol Clube; Rio Verde Esporte Clube; Sociedade Esportiva e Recreativa Chapadão; Coxim Atlético Clube e Clube Recreativo Desportivo 7 de Setembro.